COVID-19 اینٹی باڈی ٹیسٹنگ میں ٹارگٹڈ N بمقابلہ S پروٹین

پوری COVID-19 وبائی بیماری کے دوران، محققین SARS-CoV-2 کے خلاف انسانی مدافعتی ردعمل کو سمجھنے کے لیے انتھک محنت کر رہے ہیں، بشمول مدت اور تحفظ کی سطح جو کہ اینٹی باڈیز دوبارہ انفیکشن کے خلاف فراہم کر سکتی ہیں۔
کئی ٹیسٹ پہلے ہی لاگو کیے جا چکے ہیں جو SARS-CoV-2 کے خلاف اینٹی باڈیز کا پتہ لگا سکتے ہیں اور ایسے افراد کی شناخت کر سکتے ہیں جنہوں نے وائرس یا ویکسینیشن سے پہلے انفیکشن کا تجربہ کیا ہو۔
کچھ ٹیسٹ اسپائک (S) پروٹین کے خلاف اینٹی باڈیز کی موجودگی کا پتہ لگاتے ہیں، جبکہ دوسرے نیوکلیو کیپسڈ (N) پروٹین کے خلاف اینٹی باڈیز کا پتہ لگاتے ہیں۔

ایس اور این پروٹین کے بارے میں

کورونا وائرس میں چار اہم ساختی پروٹین ہوتے ہیں: نیوکلیو کیپسڈ (N)، اسپائک (S)، جھلی (M) اور لفافہ (E)۔ایس پروٹین S1 اور S2 ذیلی یونٹس پر مشتمل ہے۔ایس پروٹین انتہائی امیونوجینک ہے کیونکہ یہ وائرس کی سطح پر واقع ہے۔

سیل سے تصویر، 2020، doi:10.1016/j.cell.2020.04.011

N پروٹین وائرل RNA کی نقل اور نقل میں ایک اہم کردار ادا کرتا ہے، encapsidated genome کو virions میں پیک کرتا ہے اور میزبان خلیوں کے سیل سائیکل کے عمل کو روکتا ہے۔N پروٹین وائرسوں میں سب سے زیادہ پرچر پروٹین ہے، اور اس میں اعلی مدافعتی سرگرمی بھی ہوتی ہے۔Bاوتھاین اور ایس پروٹینSARS-CoV-2 کے اینٹی باڈی پر مبنی پتہ لگانے کے ممکنہ اہداف ہوسکتے ہیں۔تاہم، SARS-CoV-2 اور SARS-CoV کے درمیان N پروٹین ہومولوجی 90 فیصد ہے، S پروٹین (77 فیصد) کے مقابلے، خاص طور پر S1 ذیلی یونٹ بشمول RBD (66 فیصد)۔

دوسرے کورونا وائرس کی طرح، میزبان خلیوں میں SARS-CoV-2 کا داخلہ ٹرانس میبرن اسپائک (S) گلائکوپروٹین کے ذریعے ثالثی کیا جاتا ہے، جو وائرل کی سطح سے نکلنے والے ممتاز ہوموٹرائمرز کی تشکیل کرتا ہے۔

S1 subunit میں کورونا وائرس فیملی کے اندر ارتقائی کم پروٹین ہومولوجیز بھی ہیں جو تجویز کرتے ہیں کہ یہ ممکنہ طور پر مقامی کورونا وائرس کے درمیان کم کراس ری ایکٹیویٹی کا مظاہرہ کر سکتا ہے۔لہذا، S1 ذیلی یونٹ SARS-CoV-2 اینٹی باڈیز کا پتہ لگانے کے لیے مخصوص ہدف اینٹیجن ہو سکتا ہے۔

اگرچہ کورونا وائرس کے انفیکشن N کے خلاف ایک مضبوط اینٹی باڈی (Ab) ردعمل پیدا کرتے ہیں، لیکن یہ Abs بے اثر نہیں ہو رہے ہیں۔

S پروٹین ایک S1 سبونائٹ پر مشتمل ہوتا ہے، جو میزبان سیل ریسیپٹرز کو پہچانتا ہے (اور اسے A، B، C، اور D ڈومینز میں تقسیم کیا جاتا ہے)، اور S2 سبونائٹ جو انفیکشن شروع کرنے کے لیے وائرل اور سیلولر جھلیوں کے فیوژن کو فروغ دیتا ہے۔

S1 سبونائٹ ڈومین B (نام نہاد رسیپٹر بائنڈنگ ڈومین یا RBD) انجیوٹینسن کنورٹنگ انزائم 2 (ACE2) سے منسلک ہوتا ہے، جو ایک انٹری ریسیپٹر کے طور پر کام کرتا ہے۔SARS-CoV-2 RBD Abs کو بے اثر کرنے کا بنیادی ہدف ہے۔، جس کا مظاہرہ سیل پر شائع ہونے والی ایک تحقیق پر کیا گیا تھا۔

لہذا، اکیلے اینٹی باڈیز کی موجودگی اس بات کی نشاندہی نہیں کرتی ہے کہ وہ شخص دوبارہ انفیکشن کے خلاف مدافعت رکھتا ہے۔یہ تعین کرنا ضروری ہے کہ آیا اینٹی باڈیز طویل مدتی حفاظتی استثنیٰ فراہم کر سکتی ہیں، وائرس کو بے اثر کرنے والی اینٹی باڈیز فراہم کرتی ہیں جو وائرل انفیکشن کو روکتی ہیں، اور وائرل انفیکشن کو صاف کرنے میں مدد کرتی ہیں۔اینٹی باڈیز کو بے اثر کرنابنیادی طور پر کورونا وائرس میں S پروٹین کو نشانہ بناتے ہیں، خاص طور پر S1 سبونائٹ اور S1 سبونائٹ کے اندر موجود RBD، ہوسٹ سیل میں وائرل کے داخلے کو روکتے ہیں۔

سیل پر شائع ہونے والی ایک تحقیق سے پتہ چلتا ہے کہ SARS-CoV-2 سے متاثرہ 647 مضامین میں، SARS-CoV-2 اسپائک (S) اور نیوکلیوپروٹین اور nAb ٹائٹرز کے لیے Ab کے ردعمل کی شدت دونوں کلینیکل اسکورز سے منسلک ہیں۔ریسیپٹر بائنڈنگ ڈومین (RBD) امیونوڈومیننٹ ہے اور SARS-CoV-2 امیون سیرا میں موجود 90% کو غیر جانبدار کرنے والی سرگرمی کا ہدف ہے۔

حوالہ

[1] Luca Piccoli et al.SARS-CoV-2 اسپائک ریسیپٹر بائنڈنگ ڈومین پر ڈھانچے کی رہنمائی والے ہائی ریزولوشن سیرولوجی کے ذریعہ غیر جانبدار اور امیونوڈومینینٹ سائٹس کی نقشہ سازی۔سیل، 2020، doi:10.1016/j.cell.2020.09.037۔

[2] https://www.technologynetworks.com/diagnostics/blog/covid-19-اینٹی باڈی-ٹیسٹنگ-ایس-بمقابلہ-این-پروٹین-340327